Да, у нас в прошлом году с оформлением школьной карты была подобная история. Не хватало одной прививки и заведущая не хотела подписывать. По наущению школьного завуча мы попросили написать отказ в письменном виде с указанием причин и печатью. После этого карта была сразу же подписана.