Допплером измеряют скорость кровотока в сосудах - как магистральных сосудах сердца (аорта, легочноая вена и артерия, полые вены), так и скорость кровотока в сосудах пуповины, и по ней, по этой скорости уже делают выводы. Принципиально Допплер был придуман для оценки кровотока в любом месте и любых (не очень мелких) сосудах, например на нижних конечностях и т.д.