Больничные листы должны оплачивать в ближайший день впылаты заработной платы. В Вашем случае уже давно должны были выплатить. Вроде бы государственное учреждение. Странно. Обычно проверяют больничный листы если видно что человек симулирует, пьянствует и т.д., а беременность по-мойму никак не симулировать, тем более когда уже декретные пора выплачивать. Проверять по времени можно долго пока ответ не поступит из учреждения, выдавшего больничные листы.

Декретные будут рассчитывать исходя из среднего заработка за последние три месяца, сколько будет столько и насчитают.

Не в Вашем состоянии, но можно обратиться в трудовую инспекцию того района где находится организация, пусть поторопят слегка.