Не существует ограничений сейчас по срокам. Возвратите налог только тогда, когда вы его заплатите, т.е. после выхода на работу: хоть через 5 лет.
С этого года еще налоговая сама не занимается возвратом. Идете туда, если весь комплект документов на льготу уже у них имеется, то они вам выдадут справку для работы, где будет написано, что вам предоставлена льгота по НДФЛ в ... сумме, и с вас его не будут удерживать на работе.