А учитель говорила ей это один на один или при всех?
Если один на один, то это проще. Можно сходить к ней вместе с дочкой, но не для разборок, а извиниться еще раз за то, что не смогли придти, взять вину на себя. А с глазу на глаз объяснить ей, что ребенок расстроился, думает, что не нужен в школе (но опять же не наезжать, а то педагог начнет защищаться и обвинять вас), попросите лучше у нее совета, и она сама уже поговорит с ребенком.
А если при детях было сказано, то сложнее все.
А дочка сама не сможет еще понять, что учительница сказала это сгоряча, не подумав? Попросите у дочки прощения за то, что это вы в виду своей занятости не смогли придти, и за учительницу тоже.