Два вопроса: у школы лицензия и аккредитация есть? Это важно.
Действительно, нужно внимательно прочитать договор, если там есть пункт о том, что решением педсовета ребенка могут отчислить, то дальше с юристом можно подавать в суд, принимать решение о правомерности подобного исключения, но сначала договор.

И потом, если из этой школы вы все-таки уйдете, нужно обращаться в РОНО и вам будут обязаны предоставить школу, в которой ребенок сможет доучиться и сдать экзамены. Так что "никуда не возьмут" - это не проблема.