Оля, у меня Данька тоже говорит все и много и фразами. Проблема именно в произношении, нарушении слоговой структуры, как ты и пишешь, один слог из нескольких. Плюс подмена сложных звуков теми, которые легко произносятся...
У меня Данька некоторые слова говорит очень даже четко: котик, мультик, дом, домой, но в то же время не может сказать "пока", говорит "кака"... Если слоговая структура нарушена надо проверять... Нам тоже долго говорили, что ждите, заговорит, индивидуальное развитие и т.д. Но, я думаю, неврологические проблемы сами собой не рассосутся, а логопедия как раз и завязана на невролгии...